27 temporadas suma el Mallorca en Primera y 16 de ellas han sido desde que ascendió la última vez, de forma ininterrumpida. En ese tiempo, el Mallorca ha terminado dos veces en el podio de la Liga, lo que no es cualquier cosa. Fue tercero en las temporadas 98-99 y en la 00-01. Jugó por tanto dos veces la Champions, aunque la primera de ellas fue eliminado en la fase previa y no pudo jugar la fase de grupos. Estuvo a punto de terminar en puestos Champions de nuevo hace tres temporadas, pero un gol del sevillista Rodri en el último suspiro lo evitó.
Pero no fueron las dos clasificaciones para la Champions las cotas más altas del Mallorca en este período. Llegó nada menos que a una final de la Recopa en 1999, dirigido por Héctor Cúper. Cayó en la final ante la Lazio (2-1) con un gol de Nedved a falta de diez minutos, en la última edición de la historia de la Recopa. Alcanzó también la final de Copa en 1998, cayendo por penaltis contra el Barcelona y cinco años después ganó el título imponiéndose al Recreativo (3-0) en el partido decisivo. No fue el primer título de la historia del Mallorca, pues ya había logrado la Supercopa de España en el 98, vengándose del Barcelona por la derrota en la final de Copa.
En esta etapa, por tanto, el Mallorca ha ganado los dos títulos que tiene en su palmarés y también el único Pichichi y el único Zamora de su historia. Güiza fue el máximo goleador en la temporada 2007/2008 con 27 goles y Roa fue el portero menos batido en la 1998/1999 tras encajar 29 goles. Llegó incluso a ser líder de la Liga, la última vez en la jornada 17 de la temporada 98-99. De este período sale también el máximo goleador en la historia del Mallorca en Primera, que es Samuel Eto'o con 54 tantos. Una época dorada termina para el Mallorca. O quizá sólo es un punto y aparte.
